中药学论文_基于文献数据挖掘和网络药理学分析

来源:中国药理学与毒理学杂志 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2021-10-13
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摘要:文章目录 1 材料与方法 1.1 文献数据挖掘研究 1.1.1 文献来源 1.1.2 纳入标准 1.1.3 排除标准 1.1.4 文献筛选、资料提取及数据库建立 1.2 网络药理学研究 1.2.1 数据库与软件[9] 1.2.2 核心中药处
文章目录

1 材料与方法

1.1 文献数据挖掘研究

    1.1.1 文献来源

    1.1.2 纳入标准

    1.1.3 排除标准

    1.1.4 文献筛选、资料提取及数据库建立

1.2 网络药理学研究

    1.2.1 数据库与软件[9]

    1.2.2 核心中药处方靶点及腰椎间盘突出症疾病靶点挖掘

    1.2.3“药物-靶点-疾病”网络构建及蛋白互作分析

    1.2.4 靶点基因本体论富集分析(GO)和京都基因与基因组百科全书通路(KEGG)富集分析

2 结果

2.1 文献数据挖掘结果

    2.1.1 纳入研究资料

    2.1.2 中药用药频次分析

    2.1.3 中药性味和归经分布情况

    2.1.4 基于关联规则的高频药物组合分析

2.2 网络药理学分析结果

    2.2.1 核心中药的主要活性成分

    2.2.2 药物作用靶点、腰椎间盘突出症疾病靶点及构建可视化网络图

    2.2.3 靶点蛋白互作网络分析

    2.2.4 GO生物功能注释及KEGG通路富集分析

3 讨论

文章摘要:目的通过文献数据挖掘归纳分析出中药治疗腰椎间盘突出症的用药特点及规律,然后利用网络药理学的研究方法探讨高频组合中药治疗腰椎间盘突出症的潜在作用靶点及分子机制。方法系统检索中国知网(CNKI)、万方(WanFang Data)、维普(VIP)数据库中中药治疗腰椎间盘突出症的数据挖掘类文献,利用中医传承辅助平台中软件进行数据统计与分析,筛选出基于关联规则分析的中药治疗腰椎间盘突出症的高频组合,然后通过TCMSP等数据库收集这些高频组合中药的化学成分及所有有效活性成分并预测其作用靶点。通过公认的疾病数据库收集腰椎间盘突出症疾病靶点,然后将药物靶点与疾病靶点进行映射,并对关键靶点进行蛋白互作网络分析、GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析。结果研究共纳入24篇文献,处方总数共7 233张,牛膝、当归、杜仲、甘草、熟地黄等是用药频次最多的药物,温性药、甘味药在四气五味中占比最多,中药药物归经频次最多的是肝经,基于关联规则分析得出的高频中药组合为杜仲、当归、熟地黄、牛膝、白芍、甘草。高频中药组合有效活性成分63个,药物作用靶点667个,疾病作用靶点447个,两者共有作用靶点65个,蛋白互作分析中药治疗腰椎间盘突出症的关键蛋白可能是AKT1、MAPK1、PIK3R1、PIK3CA、HRAS等,涉及的细胞生物过程1 427个,细胞组成46个,分子功能81个。通路富集分析274条,其中包括VEGF信号通路、TNF信号通路、HIL-1信号通路、MAPK信号通路等。结论中药治疗腰椎间盘突出症以补益肝肾、活血化瘀药为主,同时兼以祛风寒湿药为辅。治疗腰椎间盘突出症的高频药物具有多靶点、多途径作用的特点,可能是通过影响血管生成、炎症因子、免疫调节等途径发挥治疗作用。

文章关键词:

项目基金:《中国药理学与毒理学杂志》 网址: http://www.zgylxydlxzz.cn/qikandaodu/2021/1013/749.html



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