中药学论文_基于竞争内源性RNA网络探讨槲皮素

文章目录

1 资料与方法

1.1 原始数据资料及处理

1.2 DEGs富集与功能注释

1.3 蛋白质相互作用(PPI)网络构建与关键基因选择

1.4 预测上游miRNA及lncRNA

1.5 构建ceRNA网络

1.6 网络药理学分析

2 结果

2.1 DEGs和DElncRNAs

2.2 DEGs功能及通路富集分析

2.3 PPI网络构建、模块分析及关键基因筛选

2.4 上游miRNA及lncRNA预测

2.5 ceRNA网络构建

2.6 化合物分子-蛋白对接

3 讨论

文章摘要:目的:利用从肺腺癌（LUAD）数据集中筛选的差异表达基因（DEGs）、差异表达lncRNA（DElncRNA）及其上游miRNA,构建LUAD的竞争内源性RNA（ceRNA）网络,探索槲皮素可能的作用靶点。方法:从基因表达综合数据库（GEO）及肿瘤基因组图谱数据库（TCGA）中检索并筛选LUAD基因及lncRNA表达数据集,对差异表达基因（DEGs）进行富集和功能注释。使用在线数据库预测miRNA及lncRNA,建立ceRNA调控网络,并通过网络药理学分析槲皮素的药物靶点。结果:构建了AURKA与上游hsa-miR-363-3p及AP000553.1、LINC00858、AL354707.1的ceRNA调控网络,槲皮素与5DOS对接良好。结论:AP000553.1、LINC00858、AL354707.1与hsa-miR-363-3p竞争性调控AURKA,进一步影响LUAD预后,槲皮素可作用于AURKA。

文章关键词:

论文分类号:R285

文章来源：《中国药理学与毒理学杂志》 网址: http://www.zgylxydlxzz.cn/qikandaodu/2021/1211/850.html