中药学论文_基于网络药理学和分子对接技术探讨

来源:中国药理学与毒理学杂志 【在线投稿】 栏目:期刊导读 时间:2021-09-27
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摘要:文章目录 1 资料与方法 1.1 活性成分的获取与筛选 1.2 主要作用靶点和乳腺癌疾病靶点的收集 1.3“成分–靶点”网络构建 1.4 蛋白质相互作用网络(PPI)与核心靶点 1.5 基因富集分析 1.
文章目录

1 资料与方法

1.1 活性成分的获取与筛选

1.2 主要作用靶点和乳腺癌疾病靶点的收集

1.3“成分–靶点”网络构建

1.4 蛋白质相互作用网络(PPI)与核心靶点

1.5 基因富集分析

1.6 分子对接

2 结果

2.1 活性成分与作用靶点

2.2 活性成分与靶点的网络构建

2.3 治疗乳腺癌的潜在作用靶点

2.4 靶点GO富集和KEGG通路分析

2.5 活性成分与蛋白分子对接结果分析

3 讨论

文章摘要:目的通过网络药理学和分子对接方法探讨"半枝莲–山慈菇"抗乳腺癌的作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选半枝莲、山慈菇的有效化学成分及相应靶蛋白。通过DrugBank、Uniprot数据库筛选乳腺癌潜在靶点,运用Cytoscape 3.8.0软件构建"化合物–靶点–疾病"网络图。使用STRING数据库绘制蛋白互作(PPI)网络,利用DAVID数据库对有效作用靶点进行GO功能、KEGG通路富集分析。结果共筛选出半枝莲中有效化学成分29个,山慈菇中有效化学成分3个;对应潜在作用靶点517个,乳腺癌靶点118个;将"半枝莲–山慈菇"与乳腺癌的靶点对比,获得8个药物–疾病共同靶点,包括雄激素受体(AR)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(CASP3)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-9(CASP9)、雌激素受体α(ESR1)、雌激素受体β(ESR2)、钾电压门控通道亚家族H成员2(KCNH2)、前列腺素G/H合酶2(PTGS2)和钠依赖性血清素转运体(SLC6A4)。GO功能分析得到197个条目,涉及药物代谢等方面。KEGG通路分析得到116个条目,涉及膀胱癌、非小细胞肺癌、胰腺癌、非洲锥虫病、前列腺癌、结直肠癌、子宫内膜癌等通路。结论研究揭示了"半枝莲–山慈菇"抗乳腺癌的关键靶点和涉及的生物学过程及信号通路,并结合分子对接技术,发现其作用是多靶点、多通路的,为今后的分子生物学实验奠定了基础。

文章关键词:

论文分类号:R285

文章来源:《中国药理学与毒理学杂志》 网址: http://www.zgylxydlxzz.cn/qikandaodu/2021/0927/729.html



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