中药学论文_基于生物信息学分析和网络药理学探

文章摘要:目的 基于生物信息学分析和网络药理学探讨黄连解毒汤（HuanglianjieduDecoction，HLJDD）延缓或抑制动脉粥样硬化（AS）由稳定斑块到破裂过程的作用机制。方法 首先，从GEO和ArrayExpress数据库中获取含有人颈AS稳定和破裂斑块的数据集；利用limma包和wilcoxTest来筛选差异表达基因（DEGs），再用稳健排序整合（RRA）方法筛选稳健DEGs，并进行富集分析。其次，利用TCMSP和SwissTargetPrediction数据库筛选HLJDD的活性成分及其作用靶点，并与稳健DEGs取交集，获取HLJDD-AS交集DEGs。然后，对交集DEGs进行功能富集分析，并构建蛋白互作（PPI）网络，筛选PPI网络中的子模块和Hub基因。最后，利用AutodockVina软件，将Hub基因与其所对应HLJDD的活性成分进行分子对接。结果RRA法共鉴定出864个稳健DEGs，其功能主要涉及中性粒细胞的脱颗粒、活化、炎症反应、趋化因子信号通路、PPAR信号通路、细胞粘附分子等。筛选出HLJDD有84个活性成分，928个作用靶点，获得HLJDD-AS交集DEGs有42个。GO和KEGG分析显示，交集DEGs主要涉及胶原蛋白的分解代谢、组织重构、中性粒细胞的脱颗粒、活化、PPAR信号通路、补体与凝血级联反应等。在PPI网络中，共筛选2个子模块，7个Hub基因。分子对接的结果显示，7个Hub基因与其对应HLJDD的活性成分表现出了良好的亲和力。结论 本研究揭示了以清热解毒为治则的HLJDD有效抑制或延缓AS斑块破裂的作用机制，为中医从毒论治AS易损斑块提供一定的科学依据。

文章关键词:

论文分类号:R285

文章来源：《中国药理学与毒理学杂志》 网址: http://www.zgylxydlxzz.cn/qikandaodu/2021/1102/774.html